完成了整體的實(shí)驗(yàn)室建設(shè)，在確保人員、設(shè)備、環(huán)境、方法、試劑等消耗性材料、樣品等均符合要求后，實(shí)驗(yàn)室還應(yīng)該對檢測過程進(jìn)行控制，確保影響檢測結(jié)果的因素全部受控。

實(shí)驗(yàn)室檢測過程的控制，首先要嚴(yán)格依據(jù)有關(guān)標(biāo)準(zhǔn)、規(guī)范、作業(yè)指導(dǎo)書實(shí)施檢測。確保各項(xiàng)操作由授權(quán)人員依據(jù)文件規(guī)定執(zhí)行。除此之外，實(shí)驗(yàn)過程中，應(yīng)采取一些措施，確保檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性和有效性。

以化學(xué)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)運(yùn)行為例： 

（1） 空白 

試劑空白一般每制備批樣品或每20個(gè)樣品做一次，樣品的檢測結(jié)果應(yīng)消除空白造成的影響。高于接受限的試劑空白表示與空白同時(shí)分析的這批樣品可能受到污染，檢測結(jié)果不能被接受。當(dāng)經(jīng)過實(shí)驗(yàn)證明試劑空白處于穩(wěn)定水平時(shí)，可適當(dāng)減少空白試驗(yàn)的頻次。當(dāng)檢測方法對空白有具體規(guī)定時(shí),應(yīng)滿足方法要求。 

（2） 實(shí)驗(yàn)室控制樣品 

實(shí)驗(yàn)室控制樣品(LCS)可每制備批樣品或每20個(gè)樣品做一次。LCS應(yīng)按通常遇到的基體和含量水平準(zhǔn)備，其測定結(jié)果可建立質(zhì)量控制圖進(jìn)行分析評價(jià)。當(dāng)經(jīng)過LCS測試實(shí)驗(yàn)證明檢測水平處于穩(wěn)定和可控制狀態(tài)下，可適當(dāng)減少LCS的測試頻率。 

（3） 加標(biāo) 

應(yīng)在分析樣品前加標(biāo)，基體加標(biāo)應(yīng)至少每制備批樣品或每個(gè)基體類型或每20個(gè)樣品做一次，且添加物濃度水平應(yīng)接近分析物濃度或在校準(zhǔn)曲線中間范圍濃度內(nèi)，加入的添加物總量不應(yīng)顯著改變樣品基體。 

（4） 重復(fù)檢測 

重復(fù)樣品一般至少每制備批樣品或每個(gè)基體類型或每20個(gè)樣品做一次。當(dāng)經(jīng)過試驗(yàn)表明檢測水平處于穩(wěn)定和可控制狀態(tài)下，可適當(dāng)?shù)販p少重復(fù)檢測頻率。